Ağız içi, herhangi bir hastalığa maruz kaldığında beslenme ve konuşma fonksiyonlarını bozarak hastayı sıkıntıya sokan önemli bir bölgedir.  Aft adı verilen ağrılı yaralar, pemfigus gibi kabarcıklı hastalıklar, ağız içi uçuklar, mantar hastalıkları, liken planus, yoğun sigara kullanımına bağlı lökoplaki adı verilen kanser öncüsü değişiklikler,  şeker hastalığı, demir eksikliği anemisi, pernisiyöz anemi, hipertansiyon, bağ dokusu hastalıkları (Lupus eritematozus, Sjögren sendromu) gibi sistemik hastalıklar ağız içinde değişikliklere yol açan hastalıklar arasında yer alır.  Kullanılan sistemik ilaçlar, geçirilmiş diş tedavileri (protez, implant, dolgu),  hijyen amacıyla kullanılan gargara ve diş macunları, sigara ve alkol kullanımı, diyet alışkanlıkları ağız içi bölgeyi etkileyen faktörler arasında dikkate alınmalıdır.